Menu

Matthieu LAUVERNIER

Neuilly-sur-Seine

En résumé

Passionné par les sciences, l’étude du vivant, et par bien d’autres domaines, c’est tout naturellement que j’ai orienté mes études dans les domaines de la Biochimie et des Biotechnologies, afin de me spécialiser par la suite dans le domaine de la Bioinformatique.

Ma capacité d’adaptation, ma motivation, ma curiosité, ma soif d’apprendre et d’acquérir de nouvelles compétences sont, selon moi, parfaitement adaptées à ce domaine qu’est la Bioinformatique qui allie des disciplines qui sont en constante évolution.

Astronomie, sports collectifs, arts, sciences, etc. Je me plais à multiplier les expériences dans d’innombrables disciplines et domaines et à les interconnecter, sans oublier les rencontres desquelles on peut se sentir grandi.

N’hésitez pas à me contacter, je me ferai un plaisir de répondre à toute question me concernant ou portant sur mon parcours ou mon profil.

Mes compétences :
Perl
C
JAVA
Javascript
AJAX
HTML
PHP
Python
Gtk2
Tk
R
Visual basic
Microbiologie
Biologie moléculaire
Parasitologie
Bureautique
MicroRNAs
Modélisation moléculaire
Programmation
Informatique
PCR
Base de données
PostgreSQL
Biotechnologie
Culture cellulaire
NGS
UNIX
Communication visuelle
Evénementiel
Communication événementielle
CSS
XML
Flat design
C#
Visual Basic for Applications

Entreprises

  • Infogène - Consultant en bioinformatique

    Neuilly-sur-Seine 2018 - maintenant

  • Amaris - Consultant en bioinformatique

    Genève 2015 - 2017 => Recherche & Développement, secteur Pharmaceutique :
    - Support technique sur des applications d'enregistrement et de visualisation de données biologiques pour le service.
    - Expertise VBA Excel : Développement de macros Excel complexes de traitement de données expérimentales (data management).
    - Développement d'outils en .Net ( C# ).
    - Enregistrement de données expérimentales.
    - Gestion de base de données.
    - Expertise de niveau 3.

    => Développeur sur des projets orientés web :
    - PHP
    - CakePHP
    - MySQL
    - Git (GitLab, GitKraken)
    - Bootstrap
    - CSS
    - Model / View / Controller (MVC)

  • N-Cigale - Assistant Chef de projet

    2015 - 2015 Développement de la marque.
    Gestion des fournisseurs, des contacts et des stocks.
    Refonte du système de gestion.
    Accueil, conseil et vente en boutique.
    Etc.

  • Institut National Polytechnique de Toulouse - ENSAT - Ingénieur d'Etude en Bioinformatique

    2012 - 2014 ---
    TomExpress / PlantExpress :
    BREVET DÉPOSÉ et PUBLICATION dans THE PLANT JOURNAL (25/10/2017):
    http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13711/abstract
    ---

    Logiciels développés (et leurs interfaces web) :
    • TomExpress / PlantExpress (http://gbf.toulouse.inra.fr/tomexpress): visualisation et analyse de données RNA-seq publiques normalisées sur la tomate.
    • AuxiScan : annotation fonctionnelle automatique de protéome de plante sur la voie de l’auxine.
    • HoPla : annotation fonctionnelle automatique de protéome de plante sur 4 hormones.
    • Algorithmes ad hoc.

    Bases de données développées (+ développement d'interfaces web pour les gérer):
    • PrimerManagment : gestion d’oligonucléotides pour le laboratoire (consultation, commande, etc).
    • Qualité : gestion des documents ayant trait à la qualité du laboratoire.
    • Gestion/Amélioration de bases de données existantes.

    Objectifs :

    o Développement logiciel : conception, développement, tests.
    o Conception et développement de bases de données relationnelles issues de sources hétérogènes, ainsi que maintien des bases existantes.
    o Analyse et traitement des données : réalisation d’outils interactifs de visualisation et/ou d’exploitation de méthodes d’extraction de connaissances.
    o Co-organisateur d'un Training-school "COST RNA-seq Data Analysis"​ de 3 jours : formation sur le RNA-seq de 20 personnes provenant de 9 pays différents.
    o Assistant lors d’enseignements.


    Logiciels développés (et leurs interfaces web) :
    • TomExpress (http://gbf.toulouse.inra.fr/tomexpress): visualisation et analyse de données RNA-seq publiques normalisées sur la tomate.
    • AuxiScan / HoPla : annotation fonctionnelle automatique de protéome de plante sur 4 hormones.
    • Algorithmes ad hoc.

    Bases de données développées (+ développement d'interfaces web pour les gérer):
    • PrimerManagment : gestion d’oligonucléotides pour le laboratoire (consultation, commande, etc).
    • Gestion/Amélioration de bases de données existantes.
    • etc.

  • Cepheid Europe - Stagiaire/Chargé de recherche en Bioinformatique

    2012 - 2012 Développement d'un outil de priorisation de cibles mRNAs de microRNAs humains d'intérêt basé sur des méthodes existantes de prédiction et avec interface web (HTML, PHP, Javascript, AJAX, CSS, XML)

  • Sanofi - Contrat de professionnalisation

    Paris 2009 - 2010 Création d'une base de données de résultats RT-qPCR.
    Programmation en langage Java d'une application de recherches d'informations sur les microRNAs (recodée ensuite en Python).

  • Faculté de Médecine Vétérinaire de Montréal - Stagiaire

    2009 - 2009 Stage de 3 mois au Québec, CANADA.

    Sélection de mutants d'Actinobacillus pleuropneumoniae, pathogène du porc, incapables de former du biofilm.

    Microbiologie : étalements, cultures de bactéries, etc.

    Biologie moléculaire

  • Laboratoire d'Analyses Médicales Christian BOUQUET - Stagiaire

    2008 - 2008 Stage d'observation du fonctionnement de ce type de structure.

Formations

Réseau

Annuaire des membres :