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Olivier HABRYLO

Beauvais

En résumé

Mes compétences :
Enzymologie
Phytopathologie
Gestion de projet
Vulgarisation scientifique
Animation de projets et d'équipes
Microbiologie
Biotechnology
Mycologie
R
LaTeX
Biotechnologie
Microbiology

Entreprises

  • Université Amiens Picardie Jules Verne - Ingénieur de recherche

    Beauvais 2014 - maintenant Mon activité de recherche me conduit à initier, à développer et à gérer de nombreux projets scientifiques, centrés sur l'étude d'enzymes : du gène à la protéine. Outre la caractérisation de ces enzymes permettant, par exemple, la compréhension de leur mode d'action chez une plante, ces projets innovants offrent la possibilité d'offrir aux industriels une gamme d'enzymes aux propriétés variées (pectinase).

    Travaux de recherche :
    -mise en place de systèmes d'expression de protéines recombinantes
    -expression, purification de protéines recombinantes
    -caractérisations enzymatiques
    -mise en place d'outils d'analyse des protéines
    -collaborations nationales et internationales

    Responsabilités pédagogiques :
    -encadrement de stagiaires (Licence-Master)
    -enseignement en 2e année d'IUT en TP de bioproduction
    -membre de jury de soutenances de 2e année de BTS Anabiotec

    Responsabilités collectives :
    -membre du conseil d'unité du laboratoire
    -participation à des simulations d'entretien en BTS
  • PRP Technologies - Chargé de projets expérimentation

    2013 - 2013 J'ai été en charge de la gestion des essais sous serre dans le cadre du développement de nouveaux produits (mise en place des protocoles expérimentaux, suivi des expérimentations, l'analyse des résultats)
  • Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg - Université de Strasbourg - Enseignant-Chercheur

    2011 - 2012 Lors de mon poste d'enseignant-chercheur, j'ai couplé des enseignements en école d'ingénieur de biotechnologie avec des travaux de recherches sur plusieurs thématiques.

    Lors de mes enseignements, j'ai formé et encadré des étudiants :
    - en gestion de projet en biotechnologie environnementale ;
    - et pour la réalisation de travaux pratiques d’analyse et de purification de protéines.

    Mes travaux de recherche ont été subdivisés en plusieurs thèmes :
    - la poursuite de mes travaux de doctorat, sur le thème de la phytopathologie, dont le but a été d'améliorer la caractérisation d'une des défenses de la plante face à un champignon pathogène ;
    - des travaux de recherche sur le thème de la valorisation de la biomasse : fermentation de champignons en milieu solide et liquide, production et études de cocktails enzymatiques, mise en place d’outils de suivi de la biomasse.
    Ces projets, confidentiels, ont été effectués avec partenariats industriels.
  • Association des doctorants et docteurs d'Alsace (Addal) - Présidence, trésorerie, membre actif

    2008 - 2012 Mes implications associatives m'ont permis d'acquérir de nombreuses compétences complémentaires :

    - Organisation, suivi et coordination de nombreux projets ;
    - Gestion d’équipe (de 2 à 10 personnes) ;
    - Élaboration de budgets prévisionnels (de 3 000 à 18 000 euros).
  • Université de Strasbourg - Doctorant

    Strasbourg 2007 - 2011 Mes travaux de recherche relatent de l'étude d’une des défenses de la plante face aux attaques fongiques. Ce projet, démarré à partir de l'identification d'un gène pouvant être impliqué dans les mécanismes de défenses, a abouti à la proposition d'un modèle en phytopathologie.

    La compréhension de ces mécanismes a pour but, à long terme, la réduction des produits phytosanitaires chimiques. Dans un contexte appliqué, ce projet a été multidisciplinaire, abordant les domaines de la microbiologie, de l’enzymologie, de la phytopathologie et des biotechnologies.

    Le doctorat a été pour moi l'occasion de gérer un projet scientifique de 400 000 euros sur 3,5 ans avec des partenariats universitaires (notamment en Slovénie) et industriel (Coopérative des planteurs d'houblons d'Alsace rattachée au Comptoir Agricole d'Hochfelden). Ce projet a été valorisé par plusieurs publications et conférences.

    - Habrylo O., Forster A., Jeltsch J.-M. and Phalip V. (2013). Characterization of three xyloglucanase inhibitors from
    Humulus lupulus. Phytochemistry, Accepted .
    - Habrylo O., Song X., Forster A. and Phalip V. (2012). Characterization of the four GH12 endoxylanases from the
    plant pathogen Fusarium graminearum. Journal of Microbiological Biotechnology, 22, 1118–1126.
    - Phalip V., Forster A., Carapito R, Habrylo O. and Jeltsch J.-M.(2009). Tackling Humulus lupulus fungal diseases
    by studying a Hop cell wall / Fusarium graminearum model. Acta Horticulurae, 848, 103–113.
  • Bayer CropScience - Expert microbiologiste

    Lyon 2007 - 2007 En tant qu'expert microbiologiste, j'ai réalisé l'identification macroscopique et microscopique des Fusariums sur des échantillons de blé, d'orge ou de maïs.
  • Laboratoire de biodiversité et des environnements microbiens (LUBEM) de Plouzané (29) - Stagiaire en laboratoire de recherche

    2007 - 2007 Ce stage a été effectué en partenariat industriel, avec la société Lactalis, sur la thématique de l'affinage du fromage de type Roquefort et Camembert. Ce stage a consisté en l'utilisation des techniques de PCR classique et en temps réel, le suivi de la flore des Penicilliums et la quantification par densitométrie. Ces travaux ont conduit à la réalisation d'une publication dans une revue internationale :

    Le Dréan G., Mounier J., Vasseur V., Arzur D., Habrylo O. and Barbier G. (2010). Quantification of Penicillium camemberti and P. roqueforti mycelium by real-time PCR to assess their growth dynamics during ripening cheese. International Journal of Food Microbiology, 138, 100–107.
  • Service canadien des forêts : Centre de foresterie des Laurentides - Stagiaire en laboratoire de recherche

    2006 - 2006 Ce stage de 3 mois s'est déroulé au Québec en laboratoire de recherche gouvernemental. Ces travaux en entomologie, dans le cadre de la protection des plantes, ont consisté à l'amélioration d'une formulation d'un biopesticide composé du champignon entomopathogène Beauveria bassiana. J'ai géré de manière autonome ce projet, constitué d'études sur le terrain, d'isolement de nouveaux champignons utilisables en lutte biologique et de tests d'efficacité.

Formations

  • Université Brest Bretagne Occidentale

    Brest 2006 - 2007 Master 2 recherche

    Cursus spécialisé en microbiologie des milieux extrêmes (sources hydrothermales) et non extrêmes (interactions microbiennes, lutte biologique).
    Formation en microbiologie générale et aux techniques de laboratoire.

    Synthèse bibliographique sur les techniques de quantification de la biomasse fongique.
  • Université Brest Bretagne Occidentale ESMISAB

    Plouzane 2004 - 2007 Ingénieur en microbiologie

    L'ESIAB (anciennement ESMISAB) est une école d'ingénieur en microbiologie et en sécurité des aliments.

    - Phytopatholgie, mycologie et bactériologie
    - Interactions microbiennes et micro-organismes antagonistes
    - Méthodologie, techniques de biologie moléculaire
    - Toxicologie générale et alimentaire
    - Sécurité alimentaire, assurance qualité
    - Gestion, management de l'entreprise, comptabilité.

Réseau

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