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DRVision
- Responsable technico-commercial Europe
2019 - maintenant
Responsable de la promotion et de la distribution du logiciel d'analyse d'images AIVIA dans la zone Europe :
- Présentation du logiciel et des différentes applications possibles,
- Démonstrations individuelles (avec données des clients) ou en groupe (workshops),
- Formations à l'utilisation du logiciel,
- Assistance technique sur place ou à distance,
- A l'écoute des clients pour la définition de services personnalisés,
- Présence aux conférences scientifiques à la rencontre des acteurs de la recherche utilisant la microscopie photonique/électronique.
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TOOL-IA
- Fondateur
2018 - 2019
TOOL-IA (https://tool-ia.com/fr), c'est 10 ans d'expérience à votre service :
- Design d'outils de traitement et analyse d'images personnalisés,
- Assistance à l'utilisation de logiciels divers (microscopie et analyse d'images),
- Formations en traitement et analyse d'images, individuelle ou en groupe,
- Conseils pour vos projets d'imagerie et d'analyse des images.
Mots-clés : microscopie confocale, super-résolution, automatisation, imagerie intelligente, analyse d'images, ImageJ / Fiji, Metamorph, CellProfiler, Vaa3D, VBA, biologie cellulaire.
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Université de Bordeaux
- Ingénieur de recherche
Bordeaux
2015 - 2018
Au sein du Bordeaux Imaging Center (BIC), je concentre mes efforts à la mise à disposition de microscopes photoniques dits de "super-résolution", permettant l'observation et la caractérisation de structures biologiques à l'échelle de quelques dizaines de nanomètres. Diverses techniques sont déployées pour répondre aux besoins des scientifiques, allant de la cellule à la tranche de tissu, fixé ou vivant : PALM / uPaint, dSTORM ou GSD, STED 3D.
Autres techniques utilisées : microscopie de fluorescence champ large ou confocale pour la reconstruction de mosaïques 3D multi-couleurs, vidéo-microscopie Spinning-Disk, F-techniques, scanneur de lames, etc.
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CRUK Cambridge Institute
- Microscopy and image analysis specialist
2013 - 2015
Mes activités au sein de la plateforme de microscopie du CRUK Cambridge Institute sont concentrées principalement sur 2 thèmes : la microscopie et l'analyse d'images à haut-contenu et haut-débit.
Exemples de projets:
- détection de zones tumorales et comptage des foci (détection de dommages à l'ADN) automatisés pour plusieurs milliers de coupes histologiques (TMA)
- analyse haut-contenu pour le criblage d'ARN interférents, i.e. cycle cellulaire, multinucléation, viabilité, efficacité de cytocinèse, nombres de centrosomes, etc.
- automatisation de la détection et de l'imagerie haute-résolution pour des évènements rares (sous-population cellulaire minoritaire)
Mots-clés: microscopie confocale, 3D, automatisation, High-Content Screening, "imagerie intelligente", boucle de rétro-contrôle.
Logiciels: Volocity, Imaris, ImageJ, iCys, Columbus, OMERO, Excel VBA, Matlab.
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Université de Rennes 1 / BIOSIT
- Ingénieur de Recherche
2012 - 2013
Ingénieur de Recherche au sein de la plateforme de microscopie de l'Université de Rennes 1 / BIOSIT.
Activités:
- Gestion de l’utilisation de la plateforme de microscopie
- Formations individuelles des utilisateurs, rédaction de manuels d'utilisation
- Intervenant formation continue sur les techniques d’imagerie et les outils d’analyse
- Installation de nouveaux équipements (confocal Leica SP8-FCS / High-Content, confocal Olympus FV1000)
- Réorganisation complète de la plateforme de microscopie de Beaulieu
Logiciels utilisés: ImageJ, OMERO, Volocity, Excel VBA.
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CNRS (IPBS)
- Doctorant ANRS / Sidaction
2007 - 2012
Projet : Analyse par suivi de particule unique à la surface de lymphocytes vivants de l'organisation dynamique des récepteurs CD4 et CCR5 impliqués dans l'infection par le VIH.
Accomplissements :
- mise au point complète de l’expérience de suivi de particule unique (choix cellules, anticorps, marqueur, microscope, caméra vidéo, logiciels de traitement d’image et d’analyse du mouvement des récepteurs),
- validation de l’approche de suivi de particule unique sur bicouche lipidique supportée,
- réalisation de nombreuses expériences de suivi de particule unique avec des lymphocytes immobilisés sur lamelle de verre,
- proposition d'un modèle d'organisation dynamique membranaire de CD4 et CCR5 à la surface des lymphocytes,
- collaboration avec une équipe de chimistes (Dr Fabienne Gauffre) pour la caractérisation microscopique de nanoparticules fluorescentes.
Mots-clés : microscopie de fluorescence, suivi de particule unique, cytométrie en flux, immunomarquage, nanoparticules (Quantum dots, fluosphères, colloïdes d'or), culture de lymphocytes immortalisés, programmation et analyse d’image (ImageJ, Matlab, VBA Excel).
Directeurs de thèse : Dr André Lopez et Dr Laurence Salomé
Laboratoire : IPBS - CNRS UMR5089, Toulouse
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SANOFI-AVENTIS
- Ingénieur stagiaire
Paris
2006 - 2006
Département Recherche Amont, section Lead Identification Technologies (LIT Screening), à SANOFI-AVENTIS Toulouse (route d'Espagne).
Projet : Etude cinétique des EC50 / IC50 de ligands de référence de récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) chez des lignées recombinantes de cellules animales, et étude des couplages aux protéines G par dosage de second messagers.
- validation complète des automates (essentiellement pipetage solutions aqueuses / DMSO pour
réaliser les dilutions sérielles) pour un test secondaire de criblage à haut débit (env. 3000 composés)
et mise au point de la méthode de gestion du bras robotisé et des automates
- rédaction d’une fiche standardisée détaillée de réalisation du criblage
- test de nouveaux équipements de mesure et de nouveaux kits de détection
Techniques utilisées : culture cellulaire, dosage enzymatique de type "gène rapporteur", mesure fluorométrique de l'AMPc (HTRF®, LANCE®), des inositols phosphates et du Ca2+, robotique, automates divers pour des microplaques (Beckman, Tecan, RTS, Perkin Elmer, Molecular Devices, etc).
