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INSERM UMR01087, Institut du Thorax
- Bioinformaticien
2010 - 2012
Séquençage à haut débit, administration systême.
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CEPH Fondation Jean-Dausset
- Bioinformaticien
2008 - 2010
Developpement d'outils bioinformatique en support aux équipes de biostatistiques de l'INSERM et de génotypage du Centre National de Génotypage (CNG)
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Integragen S.A.
- Responsable Bioinformatique
2006 - 2008
Responsable des developpements bioinformatique et de l'encadrement.
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Integragen
- Programmeur Scientifique, Bioinformaticien
2001 - 2006
Mise en place des bases de données permettant la gestion des données de génotypage/génomique/microarray produites localement.
Annotation de Sequences.
Developpement des logiciels spécifiques aux besoins de l’entreprise.
+ Philippi A, Roschmann E, Tores F, Lindenbaum P, Benajou A, Germain-Leclerc L, Marcaillou C, Fontaine K, Vanpeene M, Roy S, Maillard S, Decaulne V, Saraiva JP, Brooks P, Rousseau F, Hager J.
Haplotypes in the gene encoding protein kinase c-beta (PRKCB1) on chromosome 16 are associated with autism.
Mol Psychiatry. 2005 Oct;10(10):950-60.
PMID: 16027742
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Centre National de Genotypage
- Bioinformaticien
2000 - 2001
Réalisation d'outils pour le développement d'expériences de génotypage par spectrométrie de masse.
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INRA
- Thèse
Paris
1995 - 2000
RoXaN une nouvelle protéine cellulaire interagissant avec la protéine non structurale NSP3 du Rotavirus. CloneIt un outil permettant de trouver des stratégies de sous-clonage en utilisant des enzymes de restriction.
• Rotavirus, Genomic, Genetic, Virology,Two-Hybid System,Molecular Biology,PCR, cloning, cell culture, Translation,Gel electrophoresis, SDS protein page etc...
• PMID:15047801
Vitour D, Lindenbaum P, Vende P, Becker MM, Poncet D.
RoXaN, a novel cellular protein containing TPR, LD, and zinc finger motifs,
forms a ternary complex with eukaryotic initiation factor 4G and rotavirus NSP3.
J Virol. 2004 Apr;78(8):3851-62.
• PMID:9682060
Lindenbaum P.
CloneIt: finding cloning strategies, in-frame deletions and frameshifts.
Bioinformatics. 1998 Jun;14(5):465-6.
• PMID:8985320
Poncet D, Lindenbaum P, L'Haridon R, Cohen J.
In vivo and in vitro phosphorylation of rotavirus NSP5 correlates with its
localization in viroplasms.
J Virol. 1997 Jan;71(1):34-41.
Activities and Societies: Studying protein-protein interactions between ROTAVIRUS and the host cell.
Writing a tool called CloneIt selecting restriction enzymes for plasmidic construction.
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INRA
- DEA
Paris
1995 - 1996
