Simon FONTAINE

En résumé

Entreprises

• Molecular partners AG - Expert Research Associate

  2015 - maintenant

• Molecular Partners AG - Research Associate

  2012 - 2015 - Ribosome Display
  - Expression de protein dans E.Coli
  - Screening haut-debit par methodes ELISA et HTRF
  - Caractérisation des ligands par Chromatographie d'exclusion Sterique (SEC) analytique, mesure de l’affinité par Proteon, tests de Stabilité, ...
  
  Connaissances avancées en langage VBA (Visual Basic for Applications)

• MedImmune (Gaithersburg, Etats Unis) - Stagiaire

  2012 - 2012 Recherche et identification d'anticorps et de protéines alternatives (fibronectines de type III) pouvant inhiber ou activer une protéase bactérienne.
  • Découverte de ligands par « Phage Display » à partir d’une bibliothèque d’anticorps et de protéines alternatives
  • Identification des ligands par ELISAs
  • identification de ligands ayant une activité inhibitrice et d’activatrice par SDS-PAGE, ALPHAScreen et Résonance Plasmon de Surface (SPR)
  • Caractérisation d’inhibiteurs (détermination du KD et de l’IC50)
  
  Autres techniques:
  • Clonage, expression de protéines and purification (Ni-NTA, chromatographie échangeuse d’ions)
  • Elimination du tag histidine par clivage ( thrombine)
  • Logiciel Lasergene : Clonage virtuel (SeqBuilder), analyse de séquences (SeqMan), alignement de séquences (MegAlign)

• EIPL (Enzymologie Interfaciale et de Physiologie de la Lipolyse) - CNRS - Marseille - Stagiaire

  2011 - 2011 Mutagénèse dirigée au sein du site actif d’une lipase
  • Construction de plasmides (par site de restriction & TA cloning), digestion
  enzymatique, PCR, electrophorèse
  • Extraction et purification de plasmides
  • Transformations bactériennes
  • Mutagénèse dirigée (Quickchange)
  • Expression de la protéine dans E. coli et identification (SDS-Page)
  

• Unités des Rickettsie - UMR 6020 - Facultée de Médecine - Marseille (13) - Stagiaire

  2011 - 2011 Mise en place de la méthode de séquençage «Paired-end» au sein du laboratoire
  en utilisant le séquenceur 454 GS FLX Titanium de Roche.
  
  • Extraction et purification d’ADNs bactériens
  • Préparation de banques : Fragmentation de l’ADN (nebulization, HydroShear), cricularisation de l’ADN, et caractérisation de bibliothèques (Longueur et quantification)
  • PCR en émulsion et préparation des billes magnétiques pour le séquençage
  • Séquençage par méthode de Sanger

• FRE Université/CNRS 3091 « PhyMoTS » Université de Poitiers (86) - Stagiaire

  2008 - 2008 Détermination de l’effet du sulfate de fer sur un champignon pathogène de la vigne.
  • Culture de champignons en milieu liquide et solide en respectant les
  conditions de stérilité
  • Techniques d’inclusion en résine afin de préparer les échantillons en vu
  d’une analyse au microscope

Formations

• Polytech Marseille (ESIL) (Marseille)

  Marseille 2009 - 2012 Ingénieur (MSc)
  
  Biotechnologie - Education emphasis on: molecular biology, microbiology, immunology, cell biology

• Heriot-Watt University (Edimbourg)

  Edimbourg 2008 - 2009 BSc 'Cell and Molecular Biology'
  
  School of Life Sciences

• IUT Génie Biologique

  La Rochelle 2006 - 2008 • Education emphasis on: microbiology, cell biology, molecular biology, immunology.
  • Skills acquired: rigor and precision in lab manipulations.

Réseau

• Antoine MOENAERT

• Benjamin BONNET

• Cecile POGGIONOVO

• Cyril REYNIER

• Damien BRIZZI

• Geoffrey PRESSAC

• Julien MARINI

• Romain GASSIAT