LSIIT -- UMR 7005
- Doctorant
2008 - 2012
Cette thèse s'inscrit dans le cadre d'un projet européen dédié à l'étude de la maturation cérébrale au cours de la grossesse.
Le but est d'apporter une contribution en matière de segmentation des tissus cérébraux en IRM foetale. L'intêret d'une telle étude est de permettre le développement d'outils de diagnostiques pré-nataux et de fournir les moyens d'une étude des pathologies à l'échelle d'une population.
Ce travail s'est divisé en deux parties distinctes. Dans un premier temps, un nouvel algorithme de segmentation basé sur les fuzzy c-means (c-moyennes floues) a été développé. Il intègre une prise en compte des redondances de l'image, permettant ainsi de réaliser une segmentation des tissus malgré un environnement biaisé et bruité.
Dans un deuxième temps, mon travail s'est concentré sur la segmentation des tissus cérébraux en IRM foetale. Une segmentation du cortex n'utilisant que des a priori antomiques a été mise au point, ouvrant la voie à une segmentation complète des tissus cérébraux sans nécessiter l'utilisation d'un atlas statistique.
Article en revue internationale :
B. Caldairou, N. Passat, P. Habas, C. Studholme, F. Rousseau. "A non-local fuzzy
segmentation method: Application to brain MRI". Pattern Recognition, Vol. 44, Num. 11, pp. 1916--1927.
Articles dans des actes de conférences internationales à comité de lecture :
B. Caldairou, F. Rousseau, N. Passat, P. Habas, C. Studholme, C. Heinrich. "A non-local fuzzy segmentation method: Application to brain MRI". CAIP 2009, 13th International Conference on Computer Analysis of Images and Patterns, Proceedings (X. Jiang, N. Petkov, Eds.). Münster, Germany, September 2-4, 2009. Lecture Notes in Computer Science, Vol. 5702, pp. 606-613 (Springer).
B. Caldairou, N. Passat, P. Habas, C. Studholme, M. Koob, J.-L. Dietemann, F. Rousseau. "Segmentation of the cortex in fetal MRI using a topological model". ISBI 2011, 8th International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Proceedings. Chicago, IL, USA, March 30-April 2, 2011. pp. 2045-2048 (IEEE Signal Processing Society).
B. Caldairou, N. Passat, P. Habas, C. Studholme, M. Koob, J.-L. Dietemann, F. Rousseau. "Cortex segmentation in reconstructed fetal MRI by using structural constraints", CAIP 2011, 14th International Conference on Computer Analysis of Images and Patterns
