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Afm Telethon
- Responsable de bases de données en recherche pré-clinique/clinique
EVRY
2019 - maintenant
• Management des projets BDD au niveau contractuel en lien avec la direction juridique interne et du volet financier,
• Pilotage et organisation (planification des réunions, suivi des plans d’actions),
• Recrutement et identification des potentiels,
• Valorisation et suivi règlementaire des BDD,
• Participation au Plan Stratégique CAP2022 de l’AFM-Téléthon.
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Afm Telethon
- Chef projet Bioinformatique Base de données
EVRY
2016 - 2019
- Améliorer les fonctionnalités existantes (analyse fonctionnelle, rédaction des cahiers des charges) en lien avec les utilisateurs (cliniciens, ARCs),
- Rédiger, suivre les procédures d’appel d’offre (Direction SI, Direction Juridique, Direction des Achats) et gérer des prestataires extérieurs,
- Evaluer techniquement et financièrement les besoins (recette, ressource, budget),
- Garantir la qualité des données et l’interopérabilité des bases de données existantes,
- Assurer l’analyse descriptive et la collecte des données,
- Suivi règlementaire RGPD et mise en conformité des outils collectant des données de santé à caractère personnel.
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Afm Telethon
- Intitulé du poste Chef projet Bioinformatique Base de données
EVRY
2016 - 2019
- Améliorer les fonctionnalités existantes (analyse fonctionnelle, rédaction des cahiers des charges) en lien avec les utilisateurs (cliniciens, ARCs),
- Rédiger, suivre les procédures d’appel d’offre (Direction SI, Direction Juridique, Direction des Achats) et gérer des prestataires extérieurs,
- Evaluer techniquement et financièrement les besoins (recette, ressource, budget),
- Garantir la qualité des données et l’interopérabilité des bases de données existantes,
- Assurer l’analyse descriptive et la collecte des données,
- Suivi règlementaire RGPD et mise en conformité des outils collectant des données de santé à caractère personnel.
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Ministère de la Défense
- Ingénieur expert Bioinformatique
Paris
2010 - 2016
- Responsable de l'activité de séquençage massif des acides nucléiques (rédaction
du cahier des charges, suivi de l'appel d'offre, organisation des opérations de
vérification, gestion de la maintenance, des commandes et planification des
activités).
- Mise en place de stratégie, développement de pipeline d'analyses génomiques
adaptés aux besoins et formation aux utilisateurs (bases de données et logiciels
d'assemblage).
- Maintien et évolution des bases de données existantes (Souchier biologique). ;
- Définition des besoins matériels en informatique au niveau de l'Informatique
Scientifique et Technique.
- Gestion des collaborations (multi-centre, multi-entité, nationale et
internationale).
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Novacyt
- Chef de projet R&D
VELIZY VILLACOUBLAY
2010 - 2010
- Responsable du projet de numérisation des observations microscopiques des
lames dans le diagnostic du cancer de l'utérus (suivi des spécifications du cahier des charges).
- Développement de la numérisation et de l'analyse d'image pour l'aide au
diagnostic et son interface homme machine.
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Laboratoire de Génétique et Microbiologie (LGM) et Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique
- Doctorat en génomique
2005 - 2010
- Développement de programmes d’analyse (méthodes statistiques) et d’identification de régions atypiques (pathogènes) avec son interface (HTLM).
- Projet d’annotation génomique, assemblage des données issues des nouvelles technologies (454, solexa) et transfert d’un pipeline d'annotation génomique.
- Administration d’un serveur Linux avec gestion du serveur samba. Installation de logiciels sous systèmes Linux (Mandrake 10, Ubuntu) et Windows (2k, XP).
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LGM & LORIA
- Ingénieur expert en Bioinformatique
2004 - 2005
Mise en place d’une interface d’utilisateur et développement de programmes d’analyse de données utilisant les chaînes de Markov cachées
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Centre Robert CEDERGREN, université de Montréal
- Stage ingénieur
2004 - 2004
Transfert et implémentation de logiciels d’assemblage ADN d’un système Solaris à un système Linux.
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BIOZENTRUM, Institut de Recherche à Bâle, SUISSE
- Stage ingénieur
2003 - 2003
Analyse in silico du profil génomique de régulation d’un facteur de transcription essentiel chez Saccharomyces cerevisiae.
Outils utilisés: Langage d’analyse statistique R (analyse puce Affymetrix), Bioperl sous Linux.
