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Emmanuel BOUTET

SAINT-JULIEN-EN-GENEVOIS

En résumé

Ayant une formation de biologie, spécialisé en génétique des plantes, mes différentes expériences en laboratoire m'ont permis de perfectionner mes compétences en biologie cellulaire et moléculaire, ainsi qu'en physiologie végétale.

Mon travail en tant qu'annotateur du protéome des plantes me permet de valoriser mes connaissances scientifiques afin de les mettre au service de la communauté scientifique. Ma passion pour l'informatique est aussi comblée par ce positionnement à la croisées de ces deux disciplines.

Mes compétences :
Biologie cellulaire et moléculaire
Biologie végétale
Physiologie animale
Bioinformatique
Microscopie optique
Microbiologie
Informatique
Linux
Infographiste
Webmaster
Python
Php/mysql
Javascript
Html/css
Protéines
Génétique
Photographie
Gimp
Inkscape
Darktable
Open office
Microsoft office
Jardiniers amateurs
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Biocuration
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  • Institut Suisse de Bioinformatique - Annotateur

    2004 - maintenant Annotation des protéomes d'Arabidopsis thaliana et d'Oryza sativa

    Publications:
    The UniProtKB/Swiss-Prot knowledgebase and its Plant Proteome Annotation Program. Schneider M, Lane L, Boutet E, Lieberherr D, Tognolli M, Bougueleret L, Bairoch A. J Proteomics. 2009 Apr 13;72(3):567-73. Epub 2008 Nov 24. PMID: 19084081

    The Universal Protein Resource (UniProt) 2009. UniProt Consortium. Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue):D169-74. Epub 2008 Oct 4. PMID: 18836194

    UniProtKB/Swiss-Prot. Boutet E, Lieberherr D, Tognolli M, Schneider M, Bairoch A. Methods Mol Biol. 2007;406:89-112. PMID: 18287689

  • Université de Fribourg - Assistant et PhD en Biologie cellulaire et moléculaire végétale

    1998 - 2003 Thème de thèse: Études des intéractions plantes-microorganismes entre 'Pseudomonas fluorescens', 'Arabidopsis thaliana', et 'Hyaloperonospora parasitica'

    Publication dans MPMI:
    'Induced systemic resistance in Arabidopsis thaliana in response to root inoculation with Pseudomonas fluorescens CHA0.' Iavicoli A, Boutet E, Buchala A, Métraux JP. Mol Plant Microbe Interact. 2003 Oct;16(10):851-8.
    PMID: 14558686

    Assistanat lors de travaux pratiques:
    - aux étudiants en médecine: 'lipides, protides et glucides - importances de végétaux dans l'alimentation humaine'

    - aux étudiants en sciences de la vie: 'botanique générale', 'biologie cellulaire et moléculaire végétale', 'physiologie végétale', 'microscopie'

    Responsable de la salle des microscopes de recherche

    Responsable du maintient de souches de 'Hyaloperonospora parasitica', 'Pseudomonas fluorescens' et 'Botrytis cinerea'

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