Menu

Ludovic HUOT

Paris

En résumé

Conscient de se créer un réseau de compétence, j'ai pratiqué plusieurs stages afin d'acquérir une première expérience indispensable après une formation théorique à la faculté; ceci m'a permis de rejoindre divers laboratoires aux thématiques très différentes et de maitriser actuellement de nombreux domaines techniques comme la biologie moléculaire, la culture cellulaire, la microbiologie, la manipulation d'isotopes radioactifs, l'expérimentation animale niveau I, le travail en laboratoire de haute sécurité ( P3 ).
Ayant rejoint la plateforme transcriptomique de institut Pasteur de Lille, je suis spécialisé sur les microarrays ( puce à ADN) ou une connaissance et une maitrise des outils de l'ADN et de l'ARN sont indispensables à ce travail de haute technologie. Responsable du robot de dépôt et de la qualité des biopuces produites, je réalise et optimise les protocoles expérimentaux pour des collaborateurs allant de la conception jusqu'à l'exploitation des résultats (Acquisition, Analyse bioinformatique de base,...).
Toujours axé vers l'avenir, mon domaine d'investigation s'oriente désormais vers le "high speed séquencing" ( Solexa, Solid, Ion torrent,...), et entreprends sur le séquenceur Ion Torrent ( PGM, life Technologies ) des études en RNA-seq/differential RNA-seq ( small RNA, Whole transcriptome ), Chip-seq sur Eu et Procaryote en vue d'une maitrise de la technologie , et de la faire partager à de potentiels collaborateurs en terme techniques et commerciales.
Avide d'apprendre et d'élargir mes compétences, je suis prêt à étudier toutes opportunités professionnelles.

Mes compétences :
Biologie moléculaire
Travail en équipe
Gestion de projet
Biotechnologies

Entreprises

  • Institut Pasteur de Lille - Ingénieur d'etude

    Paris 2000 - maintenant Thème de Recherche : Plateforme de production, élaboration de Puces à ADN et utilisation de microarrays "home made" et commercial.
    Techniques utilisées : Biologie Moléculaire moderne; Extraction d'ARN,ADN; PCR; qPCR; Fonctionnalisation de lames de verres; Clonage; Culture cellulaire; Microbiologie; Électrophorèse; Northern blot; Manipulation d’isotopes radioactifs; Maîtrise des techniques de marquage en fluorescence et colorimétrie sur ADN et ARN; Bioinformatique; Développement de protocoles; Traitement des données; Biostatistiques ( langage R, divers script de visualisation et d'analyse );Préparation de Libraries, Séquençage sur séquenceur Haut Débit ( PGM: ION TORRENT/Life Technologies, Hi-Seq Illumina ). Gestion de budgets; Formateur; Encadrement de personnel.
  • Institut Pasteur de Lille - Technicien de Laboratoire

    Paris 1999 - 2000 Unité 167-( Prion ) - Physiopathologie des affections neurodégénératives transmissibles du système nerveux central.

    Thème de Recherche : Recherche des mécanismes de la régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle contrôlant l'expression du gène prp bovin responsable d'encéphalopathies spongiformes transmissibles.

    Techniques utilisées : Biologie moléculaire moderne; Western blot; Southern; Culture cellulaire et traitements cellulaires; Marquages métaboliques par isotopes radioactifs; Extraction d'ADN et d'ARN; Dot Blot; Immunoprécipitation; Techniques de cytométrie par fluorescence; Manipulation animale; Prélévements et réimplantations d'ovocytes; Criblage d'animaux.
    Expérimentations de souches contagieuses C.J.D (murines ,bovines
    et humaines ) en laboratoire de haute sécurité (P 3 ).
  • Institut Pasteur de Lille - Technicien de Laboratoire

    Paris 1998 - 1999 Unité 325 - SERLIA - Etude des lipoproteines et de l'athérosclérose .

    Thème de Recherche : Recherche par la technique de RAP-PCR des génes impliqués dans l'obésité et le diabéte confirmés par microarrays.

    Techniques utilisées : Biologie moléculaire moderne; Clonage; Séquençage automatique; Bioinformatique; Extraction d'ARN; Dot Blot; Northern Blot; Hybridations par isotopes radioactifs.
  • Institut Pasteur de Lille - Technicien de Laboratoire

    Paris 1997 - 1998 Stage de formation:

    Thème de recherche: Régulation génique du cancer mammaire .
    Etude de la Phosphorylation et de la régulation de l'activité du facteur de transcription ERM appartenant à la famille des oncogénes ets.

    Techniques utilisées: Biologie Moléculaire moderne: PCR; Clonage; Préparation de plasmides; Surproduction et analyse de proteines ; Immunoprécipitation; Gel retard; Electrophorése et Western Blot. Culture cellulaire; Cotransfection transitoire; Traitements cellulaires. Marquages métaboliques par isotopes radioactifs.
  • Hopital St Antoine - Cytogénéticien

    1997 - 1998 Stage de Formation:

    Thème de recherche : Diagnostique prénataux.
    Test et amélioration de protocoles en " Hybridation in situ ".

    Techniques utilisées : Culture de Lymphocytes; Mise en place de Caryotypes sur cellules prométaphasiques et métaphasiques.
    Utilisations de divers techniques de diagnostiques en " hybridation in situ " sur chromosomes et noyaux interphasiques.
  • Lycée Horticole de Lomme - Technicien de Laboratoire

    1996 - 1997 Stage de formation

    Thème de recherche : Culture in vitro en laboratoire par micropropagation.Floriculture , Conditionnement de fleurs coupées. Culture hors-sol et lutte intégrée de fleurs.
    Amélioration et culture de plantes maraîchères.
  • Publications récentes - Chargé d'étude

    1980 - 1980 Evidence for a role of the polysaccharide capsule transport proteins in pertussis pathogenesis.
    Hoo R, Lam JH, Huot L, Pant A, Li R, Hot D, Alonso S.
    PLoS One. 2014 Dec 12;9(12):e115243. doi: 10.1371/journal.pone.0115243. eCollection 2014.

    Toxoplasma transcription factor TgAP2XI-5 regulates the expression of genes involved in parasite virulence and host invasion.
    J Biol Chem. 2013 Oct 25;288(43):31127-38. doi: 10.1074/jbc.M113.486589. Epub 2013 Sep 10.

    Identification of novel TMPRSS2:ERG mechanisms in prostate cancer metastasis: involvement of MMP9 and PLXNA2.
    Oncogene. 2013 May 27. doi: 10.1038/onc.2013.176.

    Toxoplasma gondii Alba proteins are involved in translational control of gene expression.
    J Mol Biol. 2013 Apr 26;425(8):1287-301. doi: 10.1016/j.jmb.2013.01.039. Epub 2013 Feb 21.

    NOD2-mediated dysbiosis predisposes mice to transmissible colitis and colorectal cancer.
    J Clin Invest. 2013 Feb 1;123(2):700-11. doi: 10.1172/JCI62236. Epub 2013 Jan 2.

    The Toxoplasma nuclear factor TgAP2XI-4 controls bradyzoite gene expression and cyst formation.
    Mol Microbiol. 2013 Feb;87(3):641-55. doi: 10.1111/mmi.12121. Epub 2012 Dec 26.

    Increased adipogenesis in cultured embryonic chondrocytes and in adult bone marrow of dominant negative Erg transgenic mice.
    PLoS One. 2012;7(11):e48656. doi: 10.1371/journal.pone.0048656. Epub 2012 Nov 14.

    Dynamic compression of chondrocyte-agarose constructs reveals new candidate mechanosensitive genes.
    PLoS One. 2012;7(5):e36964. Epub 2012 May 17.

    Toxoplasma gondii chromodomain protein 1 binds to heterochromatin and colocalises with centromeres and telomeres at the nuclear periphery.
    PLoS One. 2012;7(3):e32671. Epub 2012 Mar 9.

    Nod-like receptor pyrin domain-containing protein 6 (NLRP6) controls epithelial self-renewal and colorectal carcinogenesis upon injury.
    Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jun 7;108(23):9601-6. Epub 2011 May 18.

    Identification of novel genes potentially involved in somatic embryogenesis in chicory (Cichorium intybus L.).
    BMC Plant Biol. 2010 Jun 22;10:122.
    Transcriptomic and genetic studies identify IL-33 as a candidate gene for Alzheimer's disease.
    Mol Psychiatry. 2009 Feb 10.

    Genetic stability of the live attenuated Bordetella pertussis vaccine candidate BPZE1.
    Vaccine. 2008 Oct 23.

    Evidence for induction of the ornithine transcarbamylase expression in Alzheimer's disease.
    Mol Psychiatry. 2007 Sep 25.

    Preparation of alpha-Oxo semicarbazone oligonucleotide microarrays.
    Curr Protoc Nucleic Acid Chem. 2005 Jan;Chapter 12:Unit 1.

    Transcriptomic analysis in the leech Theromyzon tessulatum: involvement of cystatin B in innate immunity.
    Biochem J. 2004 Jun 15;380(Pt 3):617-25.

    Differential modulation of Bordetella pertussis virulence genes as evidenced by DNA microarray
    analysis.
    Mol Genet Genomics. 2003 Jul;269(4):475-86. Epub 2003 May.

    Alpha-oxo semicarbazone peptide or oligodeoxynucleotide microarrays.
    Bioconjug Chem. 2003 Mar-Apr;14(2):430-9.

    Produits comprenant un support sur lequel sont fixés des acides nucléiques et leur utilisation
    comme Puce à ADN.
    Brevet: WO 01/42495 (07/12/2000) Institut Pasteur de Lille- CNRS- Institut Pasteur.

Formations

Réseau