Intérêts:
Méthodes pour le traitement, l'analyse et l'intégration des données biologiques et de santé publique.
Mes compétences :
Management de projet
Santé
Bio-informatique
Entreprises
Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique (EHESP)
- Enseignante-Chercheur
2010 - maintenantChargée d'enseignements en biostatistiques pour des filières allant du niveau Master au niveau Formation continue et Diplôme d'Etat.
IRISA-Biogenouest
- Chargé de mission
2010 - 2010Coordinatrice d'un projet de Génomique Intégrative qui vise à faciliter l'analyse des données hétérogènes issues de différentes plateformes technologiques (transcriptomique, protéomique, métabolomique, séquençage...)
Missions:
- Recensement des besoins des utilisateurs
- Recensement des outils d'intégration de données
- Mise en place de groupes de réfelxion sur le développement de méthodes et outils
- Propositions de formations
Fred Hutchinson Cancer Center
- Post-Doctorante
2005 - 2008Missions:
- Développement en langage R de méthodes et outils pour le traitement et l'analyse des données de cytométrie de flux à haut-débit
- Recherche du rôle des interactions protéiques dans l'expression des phénotypes chez la levure (approche in silico et in vivo)
Principales publications:
N. Le Meur et al. R and Bioconductor packages in Bioinformatics : toward systems biology. In Statistical Bioinformatics : A Guide for Life and Biomedical Science researchers. John
Wiley & Sons (2010).
F. Hahne*, N. LeMeur* et al. flowCore : a Bioconductor package for high throughput flow cytometry. BMC Bioinformatics 2009, 10 :106 (* Equal contributors).
N. Le Meur and R. Gentleman. Modeling synthetic lethality. Genome Biology. 2008, 9 :R135.
INSERM U533 - Universté de Nantes
- Doctorat en Bioinformatique
2001 - 2005Sujet:
Développement de méthodes et d'outils informatiques pour le traitement et l'analyse des données issues de la plateforme transcriptome de Nantes.
Réalisation:
- Développement en langage R de méthodes pour le contrôle qualité et la normalisation de données
- Interface utilisateur sur serveur web
Principale publication:
N. Le Meur et al. A dynamic, web-accessible resource to process raw microarray scan data into consolidated gene expression values : Importance of replication. Nucleic Acids Research. 2004 ; 32(18) : 5349-5358.
