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Sophie ABÉLANET

PARIS

En résumé

Imagerie :
Microscopie Super-Résolutive STORM (utilisation d'un système "maison"; utilisation de MatLab pour le traitement des images), microscopie photonique à fluorescence (maîtrise du microscope à champ large Leica DMI6000), microscopie confocale (Spinning Disk et LSM710/780).
Connaissances théoriques : microscopie confocale, plein champ, TIRF, multi-photons, Super-résolution (PALM, STORM, SIM, STED), FRAP, FRET, FLIM, SPIM.

Gestion Plate-Forme :
Gestion et formation des utilisateurs
Connaissances théoriques : administration et gestion d'une plate-forme, tarification, démarche qualité

Gestion :
Gestion des commandes du laboratoire, rédaction de protocoles types et de procédures d’utilisation d’appareil, encadrement et formation des nouveaux arrivants au laboratoire.
Gestion du projet Sidaction (mise au point, analyse et montage des résultats)

Anglais :
Professionnel- BULATS (Business Language Testing Service) niveau 4 (avancé)

Informatique :
Travail en environnement Mac et PC : maîtrise de Microsoft Office, Illustrator, logiciels de pilotage de microscopes : µManager (ImageJ), Metamorph, Zen, logiciels d'imagerie : ImageJ (Macros) et connaissances sur Imaris, notions de programmation Pyhton, MySQL et MatLab, logiciels de cytométrie : CelleQuestPro, Optima (Control et Analysis)

Hygiène et sécurité :
Habilitation au travail en laboratoire de sécurité 2 (P2) et 3 (P3). Habilitation à la conduite d'autoclave

Biologie Cellulaire :
Culture de cellules primaires et lignées cellulaires en confinement P2, purification de monocytes à partir de poches de sang, transfections transitoires de cDNA plasmidiques et ARNi, établissement de lignées stables, immunofluorescence, cytométrie en flux (FacsCalibur, Accuri C6)

Biologie moléculaire :
Purification ADN plasmidique, ADN génomique et ARN, PCR, clonage, RT-PCR, qPCR

Virologie :
VIH-1, culture de cellules en confinement P3, production de virus (VIH-1), infection, développement de tests virologiques, production et transduction par des lentivecteurs (shRNA, ORF)

Biochimie :
Immunoprécipitation, westerns blot, HTRF, ELISA, production et purification de protéines recombinantes (His, MBP, GST)

Génomique :
Comparative Genome Hybridization CGH et analyse des résultats de puces à ADN (Genespring 7.3.1)










Mes compétences :
Gestion
Biologie cellulaire
Biochimie
Culture cellulaire
Biologie moléculaire
Hygiène et sécurité
Imagerie Photonique

Entreprises

  • Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire - Plate-forme d'imagerie photonique - Valbonne - Ingénieur d'Etudes

    2017 - maintenant
  • Ecole Thématique de Microscopie Fonctionnelle en Biologie - Seignosse - Aide à l'organisation - Equipe Culture Cellulaire

    2016 - 2016 Accueil et aide aux porteurs d'atelier en culture cellulaire - animation d'un atelier
  • Institut Jacques Monod - Imagoseine - Plate-Forme d'Imagerie Photonique - Paris - Ingénieur d'études

    2015 - 2016 Gestion de deux microscopes confocaux (LSM710 et 780) et d'un plein champ Zeiss dans le parc de la Plate-Forme.
    Assurer les formations aux nouveaux entrants
    Aider les utilisateurs au mieux sur leur projets respectifs
  • Institut Pasteur - Unité Imagerie et Modélisation - Paris - Ingénieur d'Etude

    2015 - 2015 Imagerie Super-Résolutive de la capside du VIH et analyse de sa morphologie sous la direction du Dr. Christophe Zimmer
  • Ecole Thématique de Microscopie Fonctionnelle en Biologie - Seignosse - Aide à l'organisation - Equipe Culture Cellulaire

    2014 - 2014 Accueil et aide aux porteurs d'ateliers pour la culture et la gestion des lignées cellulaires
  • Institut Pasteur - Unité Imagerie et modélisation - Paris - Ingénieur en Contrat de Professionnalisation

    2014 - 2015 Imagerie Super-Résolutive de la capside du VIH et analyse de sa morphologie sous la direction du Dr. Christophe Zimmer
  • Institut Curie - Unité Stress et Cancer - Paris - Assistant Ingénieur

    2013 - 2014 Identification et caractérisation d'un marqueur pronostique dans le cancer de l'ovaire.

    Publication :
    Gruosso T., Garnier C., Abelanet S., Kieffer Y., Lemesre V., Bellanger D., Bieche I., Marangoni E., Sastre-Garau X., Mieulet V., Mechta-Grigoriou F. "MAP3K8/TPL-2/COT is a potential predictive marker for MEK inhibitor treatment in high-grade serous ovarian carcinomas", Nature Communication
  • Institut Cochin - INSERM U1016 Laboratoire 'Interactions Hôtes-Virus' - Paris - Assistant Ingénieur

    2008 - 2013 Criblage de molécules anti-HIV dans le cadre du projet européen FP7 HIV-Ace
    Projet de Recherche sidaction sous la direction du Dr. Clarisse BERLIOZ-TORRENT

    Gestion du projet Sidation (Mise au point, analyse et montage des résultats)
  • Institut Pasteur - Unité de Biologie et Pathogénicité Fongiques - Paris - Apprentie

    2007 - 2008 Travaux d'analyse génomique dans le cadre du projet européen ERAES sous la direction du Dr. Marie-Elisabeth BOUGNOUX (Laboratoire du Dr. Christophe DENFERT)

    Publication :
    Angebault C, Djossou F, Abélanet S, Permal E, Ben Soltana M, Diancourt L, Bouchier C, Woerther PL, Catzeflis F, Andremont A, d’Enfert C, Bougnoux ME.
    Candida albicans is not always the preferential yeast colonising humans: a study in Wayampi Amerindians, J. Infec. Dis. 2013 Jul 31 (PMID : 1605544)
  • Laboratoire de Virologie UPRES EA 3500 UFR St Antoine - Stagiaire de deuxième année de BTS

    2006 - 2007 Participation aux travaux de recherche sur la génétique des Rotavirus sous la direction du Dr. Axelle DEHEE (Laboratoire du Dr. Antoine GARBARG-CHENON)

    Présentations orales :
    Troupin C, Dehée A, Deback C, Abélanet S, Poncet D, Vende P, Garbarg-Chenon A. A selection-free reverse genetics system for rotaviruses based on the preferential packaging of rearranged genomic RNA segments, 3rd European Rotavirus Biology Meeting, 13-16 September 2009, Loch Lomond, Scotland.

    Troupin C, Dehée A, Deback C, Abélanet S, Poncet D, Vende P, Garbarg-Chenon A. A selection-free reverse genetics system for rotaviruses based on the preferential packaging of rearranged genomic RNA segments, abstract n° 010, 10th International Symposium on Double-Stranded RNA Viruses, 21-25 June 2009, Hamilton Island, Queensland, Australia.
  • Laboratoire de Virologie UPRES EA 3500 UFR St Antoine - Stagiaire de première année de BTS

    2006 - 2006 Participation aux travaux de recherche sur la génétique des Rotavirus sous la direction du Dr. Axelle DEHEE (laboratoire du Dr. Antoine GARBARG-CHENON)

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