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Vincent ALBUFERA

Paris

En résumé

Mes compétences :
Biologie
Biologie cellulaire
imagerie
Imagerie médicale
JAVA
Langage C
Langage C#
Langage C++
Linux
Matlab
Microsoft Pack Office
Neurosciences
Physiologie
Programmation
Python

Entreprises

  • CNRS - Ingénieur en traitement d'images 3D obtenues par tomographie à rayons X

    Paris 2012 - maintenant Mars 2012 - Mars 2013

    Grâce aux nouveaux développements de la tomographie synchrotron, il est maintenant possible d'imager l'évolution de matériaux sur des échelles de temps inférieures à la seconde, et d'aller ainsi sonder des mécanismes jusqu'ici inexplorés de la transformation de ces matériaux.
    De telles expériences produisent en général des jeux de données de très grande taille, pour lesquelles il est important d'avoir des méthodes de traitement d'image automatisées, efficaces et rapides.

    Réalisations :
    - Élaboration d’une nouvelle méthode d’implémentation d’un algorithme de segmentation d’image à base de graphes sous python.
    - Utilisation d’algorithmes à base de graphes
    - Utilisation de Cython
    - Visualisation et analyse d’images 3D via Mayavi

    Outils :
    Spyder (IDE), Enthought Python Distribution, Mayavi, Github

  • Diagnostica Stago - Stage de fin d'étude en R&D - Systèmes spécialisés (9 mois)

    Asnières-sur-Seine 2011 - 2011 Mars 2011 - Décembre 2011

    Projet confidentiel : Étude et mise au point d'un nouveau test d'hémostase
    - Analyse et traitement de résultats biologiques (validation automatique d'un test) : lancement de différents tests sur le dispositif de diagnostic in vitro et établissement de différents critères de bon fonctionnement de l’instrument de mesure
    - Modélisation mathématique du système de mesure pour le calcul des résultats : optimisation du modèle actuel et proposition d’un nouveau modèle

    Outils :
    Matlab

  • Laboratoire Images, Signaux et Systèmes Intelligents (LiSSi) - Projet tutoré

    2010 - 2011 Novembre 2010 - Janvier 2011

    Il existe des outils permettant la visualisation des enregistrements vidéo et des signaux EEG et l’analyse du comportement de l’animal. Mais ces outils ne sont accessibles qu’en ligne de commande. La mission était donc de regrouper ces outils sous un même logiciel en se servant de Qt sous linux.

    Réalisation :
    - Familiarisation avec l’environnement Qt
    - Intégration de l’analyse des données au projet (sélection des paramètres, calcul des paramètres)

    Outils :
    Linux et Qt

  • Centre de recherche de l'institut universitaire de gériatrie de Montréal (CRIUGM) - Stagiaire recherche (4 mois)

    2010 - 2010 Mai 2010 - Aout 2010

    Le projet consiste à étudier la plasticité de la moelle épinière associée à l’apprentissage moteur. Des méthodes non-invasives de neuro-imagerie, et plus particulièrement l’IRMf, ont permis de caractériser la plasticité cérébrale lors d’un apprentissage moteur, mais aucune étude n’a encore exploré ce phénomène au niveau de la moelle épinière.
    Ce projet a pour but général de combler ces manques et donc d’évaluer la plasticité spinale au cours de l’apprentissage moteur. Vu la nouveauté de l’IRMf spinale, il est nécessaire de valider cette technique ainsi que de s’assurer de la fiabilité des résultats avant d’utiliser dans une recherche sur la plasticité spinale durant l’apprentissage moteur.

    Réalisations :
    - Analyse des images fonctionnelles de l'IRM cérébrale en réponse aux stimulations électriques évoquant un réflexe spinal
    - Amélioration de l’analyse des images fonctionnelles de l'IRM spinale en tenant compte des artefacts de mouvements

    Outils :
    Matlab, Brain Voyager QX (environnement d’analyse et de visualisation d’images fonctionnelles et anatomiques de l’IRM)

  • Laboratoire Images, Signaux et Systèmes Intelligents (LiSSi) - Projet tutoré

    2009 - 2010 Novembre 2009 - Avril 2010

    Le projet consiste à concevoir un outil pouvant constituer une aide dans le diagnostic de la lipodystrophie en calculant l’épaisseur de la peau au niveau du visage grâce à la segmentation des os et tissus cutanés de la face en IRM et Scanner. Mais des artefacts lumineux au niveau de la mâchoire posent problème pour le calcul de l’épaisseur de la peau à ce niveau.

    Réalisation :
    Résolution du problème du calcul de l’épaisseur de la peau au niveau de la mâchoire par la méthode des contours actifs.

    Outils :
    Matlab

  • Hôpital Henri Mondor de Créteil - Stagiaire technicien au service immunologie - biologie

    2009 - 2009 Juillet 2009

    Application de la biologie moléculaire au diagnostic de lymphome

    Réalisation :
    - Extraction d’ADN, d’ARN de lymphocytes
    - PCR

  • Acadomia - Enseignant en Mathématiques

    Paris 2009 - 2010 Novembre 2009 - Septembre 2010

    Soutien en Mathématiques de 2 élèves, 3 heures par semaines

  • Centre d'étude de la SensoriMotricité (CESEM) - Stagiaire recherche

    2008 - 2008 Juillet 2008 - Aout 2008

    Études et analyses comportementales de nage du têtard : Analyse cinématique de la tête pendant la nage de Xenopus laevis

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