Christine HOOGLAND

En résumé

Entreprises

• FIND - Clinical Data Scientist

  2020 - maintenant - Gestion des données cliniques: revue et implémentation des eCRFs, support SDV, gestion des requêtes, création de rapports, etc.
  - Support bioinformatique à la gestion et l'analyse de données tNGS pour le diagnostic des résistances aux médicaments antituberculeux.

• FIND - Biobanking Data Scientist

  2019 - 2019 - Responsable de la Biobanque clinique: gestion, caractérisation et suivi des échantillons collectés, interaction avec les équipes cliniques et les partenaires de l’entrepôt, sélection des échantillons demandés, intégration des données clinique et échantillons, création de rapports, etc.

• NovImmune - Clinical database developer

  2016 - 2019 - Mise en place, validation et suivi des bases de données cliniques, programmation et validation des contrôles de cohérence, émission des requêtes et intégration des réponses, création de rapports, documentation technique (DMP, DVP, SOP), conception/annotation de CRF, import/export/réconciliation de données internes/externes, design et développement d'interface web (eCRF, reporting), contrôle qualité, réglementations en vigueur, bonnes pratiques cliniques, standards CDISC et codage des données (MedDRA, WHO-Drug), relation CRO.

• Queensland Institute of Medical Research - Senior research officer

  2012 - 2015 Pipelines pour l'analyse de données protéomiques (identification et caractérisation de modifications post-traductionnelles, protéogénomique, PROTOMAP), typiquement conversion de fichiers, extraction, filtrage et nettoyage de données, intégration et visualisation, soumission de jobs sur cluster de calculs.
  Développement de base de données dédiées : design et implémentation, interface web de saisie et requêtes, sauvegardes et archivages.

• Université de Genève - Collaborateur scientifique

  Genève 4 2009 - 2011 Développement (en équipe, partage du code) d’applications bioinformatiques (web et locales) pour la protéomique : conversion de données, automatisation de pipeline, analyse et gestion de données expérimentales, interface graphique, etc. incluant spécifications selon les besoins utilisateurs, assistance et formation des utilisateurs, administration.

• Institut Suisse de Bioinformatique - Responsable de recherche

  1997 - 2010 • Responsable de plusieurs serveurs web scientifiques (www.expasy.org, www.expasy.org/ch2d/, world-2dpage.expasy.org/repository/, miapegeldb.expasy.org, www.swissproteomicsociety.org, www.eupa.org,…), avec/sans base de données : configuration, administration, design, implémentation, développement, support utilisateur, etc. de la partie web comme base de données.
  • Participation à un groupe de travail international pour la définition de standards de représentation et d'échange de données protéomiques, implémentation et contribution à la dissémination de ces standards.
  • Participation aux spécifications et à l’implémentation de modules dédiés à la protéomique pour SQL*LIMS (Applied Biosystems).
  • Publications scientifiques dans revues internationales, chapitres de livre, présentations orales ou posters à des conférences nationales et internationales.
  • Enseignements (introduction Unix, base de données).
  • Encadrement d’étudiants (master, thèse de doctorat).
  • Membre de comité exécutif (Société Suisse de Protéomique), comité éditorial de revues scientifiques (Journal of Proteomics, Proteomics), comité d’organisation de conférence.

• Université Claude Bernard-LYON1, Villeurbanne (69) - Doctorant

  1993 - 1996 • Développement d’une base de connaissances sur la localisation chromosomique des éléments transposables chez la drosophile, implémentation de tests statistiques dédiés.
  • Publications scientifiques dans revues internationales, présentations orales à des conférences nationales et internationales.
  • Enseignements (initiation à l’informatique (Word, Excel), introduction à la programmation en C).

Formations

• Clinact Formation

  Sevres 2016 - 2016 Clinical Data Manager
  
  Mise en œuvre des différents aspects de la gestion des données des études cliniques de l'élaboration des CRFs (papier ou électronique) au gel de la base, mise en place et validation de la base de données, programmation et validation des contrôles de cohérence, émission et intégration des requêtes, codage des données (MedDRA, WHO-Drug), rédaction de la documentation technique, réglementations en vi

• Université Lyon I - Claude Bernard

  Villeurbanne 1992 - 1996 Biométrie, Génétique des Populations
  
  Génétique

• Université Paris 11 Paris Sud

  Orsay 1987 - 1992 Biochimie, Biologie moléculaire et Génétique

Réseau

• David PERRET

• Emmanuel BOUTET

• Frédéric NIKITIN

• Géraldine CIZERON-CLAIRAC

• Jérôme GARIN

• Laetitia DESJARDINS

• Loïc DAYON

• Natacha TURCK

• Valérie AVEQUIN

• Veronique BRUSA