Menu

Pierre-François ROUX

Paris

Electionsmunicipales 2026

RETROUVEZ GRATUITEMENTLe résultat des municipales à Paris.

En résumé

Les recherches en biochimie, en biologie cellulaire et moléculaire et en génétique se sont vues profondément bouleversées au cours de la dernière décennie, du fait de l’avènement des approches haut-débit, concomitant au développement rapide des biotechnologies. A l’issue de ma formation d’ingénieur – très orientée biologie cellulaire, moléculaire et génétique – afin de faire face à l’avalanche de données générées, de répondre à des questions biologiques toujours plus intégratives, et de relever les nouveaux défis méthodologiques et techniques associés, j’ai saisi l’opportunité du doctorat pour me former aux approches bio-informatiques et bio-statistiques par la recherche, pour au final me rallier progressivement à des travaux en lien avec l’épigénétique et la biologie des systèmes appliquées à l’oncologie et au vieillissement.

Thématiques de recherche : génomique – génomique fonctionnelle – génétique quantitative – épigénétique – biologie des systèmes – réseaux de régulation – sénescence cellulaire

Mes compétences :
Analyse de données
Cancérologie
UNIX
R
Recherche
Perl
Biologie moléculaire
Biostatistiques
Biologie cellulaire
Bio-informatique
Génomique
Génétique

Entreprises

  • Institut Pasteur - Postdoctoral Researcher

    Paris 2015 - maintenant Toward a systems view of cellular senescence.

    Cell fate decisions entail organized changes in gene expression. A fundamental question
    in biology is how genes and regulatory regions are organized and coordinated for
    transcription regulation in these processes. Recent findings, including those of the
    Bischof team, have demonstrated that alterations in chromatin architecture play a
    decisive role in gene-regulation, but their importance in cell-fate decisions is still unclear.
    To close this important gap in our knowledge, we seek to explore the role of chromatin
    structure changes in cellular senescence, a cell-fate crucial for tumor suppression
    and aging. We hypothesize that active co-regulated genes and their regulatory factors
    coalesce in enhancer-promoter hot spots optimized for efficient and coordinated
    transcriptional control to enforce the senescence phenotype. To prove this hypothesis
    correct, we will combine genome-wide gene expression, epigenome and chromatin
    structure studies in cells undergoing senescence and leverage the expertise of the
    Bischof lab in these domains and my own expertise in high-throughput
    sequencing and transcriptomic data analyses.

  • INRA - Doctorant

    Paris 2011 - 2014 Detecting single nucleotide polymorphisms at the genome scale for the genetic dissection of complex traits and the characterization of editomes

    Next-generation sequencing technologies (NGS) have progressively revolutionized genetic and transcriptomic research fields since their democratization at the end of the 2000s. While there were mainly used to decipher genomes for many species, major sequencing cost decreases gradually allowed studies focusing on individual genomes and transcriptomes. Studies I have been working on durning my PhD highlight the potential of single nucleotide polymorphisms detection in a high-throughput manner at the genome and transcriptome-wide scales thanks to NGS, for the genetic dissection of complex traits, and for the identification of RNA editing events. The original aspect of our works is lying on the integrative strategy we used to genetically dissect the adiposity, based on several genetic and expressional approaches such as QTL and selective sweep mappings, SNP annotation and prioritization, differential expression and allele-specific expression analyses. Combining those complementary approaches allowed us to shed light on two new candidate genes for the adiposity regulation: JAG2 and PARK2. Focusing on the description of RNA editing events, we report the first studies describing editomes in a non-mammalian vertebrate species - the chicken - and highlight how limited is this phenomenon. We also reveal that environmental and genetic factors such as sex, age, genotype and diet regulate editing levels. Currently, some artifacts related to NGS are still neglected in many studies. Here, we clearly show that ignoring them may deeply impact analyses focusing on rare events such as RNA editing.
Une expérience absente ?

Vous avez travaillé avec Pierre-François dans une entreprise qui n'apparaît pas dans son parcours ?

N'hésitez pas à lui suggérer d'ajouter cette expérience en lui envoyant un message. Pour cela ajoutez d'abord Pierre-François à vos contacts.

Formations

Réseau

Annuaire des membres :