Fabien BARBIER

En résumé

Entreprises

• Baylor Institute for Immunology Research - Développeur

  2009 - maintenant J'ai rejoins l'équipe du Baylor Institute for Immunology Research en janvier 2009.
  
  Exemples de mission :
  
  ° Développement d'applications pour le LIMS(Laboratory Information Management Systems).
  
  ° Développement d'outils pour la capture des données du laboratoire(automatisation des Backups, importation des données dans le Système d'information).
  
  ° Développement d'un «agrégateur» web interactif à partir de sources multiples, classification des informations afin de faciliter l'interprétation des données biologiques, comprenant les résultats des puces à ADN, une description de l'expérience, ainsi que des informations cliniques.
  
  ° Création de formulaires électronique(eCRF) spécifiquement utilisés dans la recherche d'essais cliniques. Utilisation d'OpenClinica pour la conservation des données sur chaque patient participant à l'essai clinique.
  
  ° Développement d'applications web sous R via SHINY (outils pour analyses Genomiques).

• Openwebconseil - Associé

  2006 - 2008 Au cœur des nouvelles technologies de l’information et du Web, Openwebconseil sélectionne, intègre et développe des outils de gestion de contenu (CMS) à partir des solutions leader du monde libre et Open Source.
  
  Openwebconseil propose l’ensemble de ses services : aux grands comptes, aux collectivités locales, aux associations, ainsi qu'aux PME/PMI.
  
  Le choix d’intégrer des logiciels libres nous permet de vous garantir des coûts inférieurs aux solutions propriétaires.
  Ainsi nous pouvons nous concentrer sur notre véritable métier : le conseil, l'intégration, l'accompagnement et l'assistance.

• INSERM - Bioinformaticien

  PARIS 13 2001 - 2008 J'ai rejoins l'équipe de Bioinformatique d'une Unité INSERM en janvier 2001 afin d'apporter mes compétences en gestion de projet et en ingénierie Informatique.
  
  Exemples de mission :
  
  2002-2008 Mise en place d’une plateforme de Bioinformatique
  
  ° Implementation d'un workflow pour la modélisation moléculaire (prédiction de complexe protein/protein par docking, analyse électrostatique et interface alanine scanning).
  
  ° Développement d'outils bioinformatique pour l'étude des polymorphismes cytokine/recepteur (analyse fonctionnelle et structural des SNPs codant).
  
  ° Implémentation d’un Intranet U564 (mise en place d’un Meta-serveur d'analyses bioinformatique).
  
  ° Analyse phylogénétique et synthénique de cytokines/récepteurs avec screening de gènes orthologues.
  
  
  2001-2002 Mise en place d’outils pour la bioinformatique
  
  ° Création d’un programme de recherche d’entropie.
  
  ° Mise en place d'outils bioinformatique afin d’identifier de nouvelles cytokines(recherche évolué dans les bases de données).
  
  ° Études multiples In-silico de gènes cibles (identification 1D, 2D & 3D, analyse de fold), étude structure Exon - Intron.

Formations

Réseau

• Benjamin LEMOINE

• François ROUSSEAU

• Isabelle FREMAUX

• Julia CHÉRIER

• Linda GRIMAUD

• Sandrine GIRAUD

• Stéphane POURPE

• Typhanie MAUROUARD

• Yannic DANGER